Si no quieres fabricar una pieza con las dimensiones de la bahía 3.5, puedes utilizar cinta doble cara para fijar el disco a una superficie horizontal. Deberás utilizar 2 secciones de cinta para que una apoye a la otra.
Lo otro es, ver si se puede utilizar el soporte donde estaba alojado el HDD en la mini, lo adaptas a alguna bahía.
Suerte.