Teoricamente no tendrias que tener ningun problema, en un disco sata II conectado a una MOBO sata I, con respecto al rendimiento, en realidad la diferencia entre Sata II y I no deja de ser anecdotica, pues ni siquiera los discos mas rapidos del mercado logran siquiera ocupar la mitad de la velocidad de transferencia que ofrece el puerto en su primera vercion. Si hay diferencias, de igual manera no dejarian de ser muy marginales, entrando incluso en el margen de error de los benchmark.
como dice Luis, en general eso se configura mediante un jumper
Yo que tu nisiquiera me preocupara por eso
