Fijate que entre otras razones (como la que dice Snipe) eso tambien se da porque los navegadores empiezan la descarga a un buffer interno mucho antes de que vos le des clic a "guardar " ó a "abrir".
Por eso, para cuando se abre la ventana de progreso ya ves la velocidad con la que el buffer se esta vaciando al disco duro hasta que se acaba y empieza a decrecer.
Como comprobar esto?, facil, abri Firefox por ejemplo, empeza a descargar un archivo de un par de megas, pero no le des "guardar a disco" inmediatamente, esperate unos 30 segs en esa pantalla, y luego le das clic a "guardar a disco", ahi vas a ver como "magicamente" descargas como un mega en un segundo.