Seria bueno chequear los programas que inician con la pc, eso lo haces desde INICIO, luego EJECUTAR, y escribo msconfig, una vez ejecutado vas a inicio y asegurate de que solo inicie el anti virus con la pc, dan aplicar y reinician, luego vas a la ruta que te muestra que esta alojado el virus o troyano, tratas de eliminarlo como si fuera un archivo comun, si no les deja eliminarlo, haces CRONTOL + ALT + SUPRIMIR, y buscas en el administrador de tareas el proceso de ese virus o troyano, luego lo terminas, haz logica pura, si tienen el msn conectado es logico que les aparesca en la rama de procesos de su pc msnmsgr.exe, ya que estas estan usando el mensajero, si tuvieran una pagina abierta, es logico que tienen que tener el iexplorer.exe, asi vas relacionando, hasta que encuentran los procesos que piensas que son sospechos, lo termias, una vez que matas el proceso de su pc ahi si podran eliminar el virus o troyano de tu pc, por que mientras este ocupando un proceso, jamas lo podran eliminar.
Otra manera seria por medio de SAFEMODE